Emne - Bioinformatikk og Biopolymere materialer, fordypningsemne - TBT4508
Bioinformatikk og Biopolymere materialer, fordypningsemne
Velg studieårOm
Om emnet
Faglig innhold
I 'Biopolymere materialer' vil det bli lagt vekt på biologiske makromolekylers egenskaper og oppførsel ved konsentrasjoner over kritisk ovelappkonsentrasjon, så som viskositetprofil, orden/uorden-overganger, geldannelse, viskoelastiske egenskaper og faseoppførsel ved blanding av makromolekyler. Eksempler på anvendelse av biopolymere vil bli gitt med spesiell vekt på biomedisin og biopolymere brukt i immobilisering av celler og enzymer. Demonstrasjon av reologisk utstyr for karakterisering av myke materialer vil bli gitt.
Bioinformatikk-delen (50 %) gir en omfattende introduksjon til DNA-analyse. Hver student mottar en "rå" DNA-sekvens på ca. 20 kb i størrelse med en opprinnelse (bakteriell, arkeal eller eukaryotisk) som er ukjent for studentene. Studentene analyserer sekvensen basert på et sett av spørsmål gitt i kompendiet. Kurset benytter en praktisk tilnærming til å oppnå alle oppgavene, noe som krever at studentene bruker et bredt spekter av elektroniske bioinformatikkverktøy. Studentene leverer rapporter underveis i semesteret, som hver bygger på den foregående rapporten, og som tilsammen gir grunnlag for vurdering.
Læringsutbytte
Biopolymere materialer: Grunnleggende kunnskap om biologiske biopolymere i konsentrarte løsninger og geler, materialer basert på disse og hvordan slike materialer kan skreddersys og endres til definerte egenskaper. Bioinformatikk: Studenten lærer å lese DNA.
Læringsformer og aktiviteter
Biopolymere materialer: Forelesninger og demonstrasjoner. Bioinformatikk-delen undervises etter prinsippet om problembasert læring.
Mer om vurdering
Biopolymere materialer: Skriftlig eksamen.
Bioinformatikk: Basert på rapport. Hver karaktergivende del (skriftlig eksamen i Biopolymere materialer, rapport i Bioinformatikk) teller 50 % av karakteren i emnet.
Både arbeider og skriftlig eksamen må være bestått for å få bestått i emnet.
Ved utsatt eksamen kan skriftlig eksamen bli endret til muntlig eksamen. Ved stryk eller gjentak kan studenter velge å ta bare én av vurderingsdelene på nytt.
Anbefalte forkunnskaper
Det forutsettes normalt kunnskaper i bioteknologiske basisemner tilsvarende TBT4107 Biokjemi 2, TBT4110 Mikrobiologi, TBT4145 Molekylærgenetikk og TBT4135 Biopolymerkjemi. Bioinformatikk: grunnleggende kunnskap innen biokjemi, mikrobiologi og cellebiologi; e.g. TBT4102 Biokjemi 1, TBT4107 Biokjemi 2, TBT4110 Mikrobiologi eller tilsvarende.
Kursmateriell
Oppgis ved kursstart. Bioinformatikk: Oppgis ved kursstart. Studentene benytter åpen tilgjengelige nettsider/programvarer.
Studiepoengreduksjon
| Emnekode | Reduksjon | Fra |
|---|---|---|
| BT3220 | 3,7 sp | Høst 2020 |
| TBT4506 | 3,7 sp | Høst 2020 |
| TBT4507 | 3,7 sp | Høst 2020 |
Fagområder
- Teknologiske fag