Instituttets ​​​​​​forskningsaktivitet er organisert i seks fagenheter og fire kjernefasiliteter. Vi har mange forskningsgrupper som tematisk er knyttet til en overliggende fagenhet. En av fagenhetene er Senter for molekylær inflammasjonsforskning (CEMIR), et senter for fremragende forskning (SFF). Instituttet har fire kjernefasiliteter innen gen- og proteinanalyser, avansert cellulær avbildning og bioinformatikk.

Institutt for klinisk og molekylær medisin tilbyr undervisning for profesjonsstudiet medisin, basalmedisinske fag, laboratoriefag, indremedisin, kirurgi, kvinnesykdommer og barnesykdommer. Instituttet tilbyr masterstudier i farmasi, fedme og helse, palliasjon og et internasjonalt masterstudium i molekylær medisin. Vi tilbyr etter- og videreutdanning i de samme fagene, i tillegg til undervisning i ultralyddiagnostikk for jordmødre.

Institutt for klinisk og molekylær medisin er NTNUs største, med 450 ansatte og vi disponerer vel 4000 kvadratmeter laboratorieareal. Vi forvalter forskningsprosjekter for nærmere 180 millioner kroner årlig. Instituttet er samlokalisert med St. Olavs hospital og disponerer lokaler over store deler av Campus Øya.

​​​​​​