JExercise finnes i en egen variant som kan kjøres utenfor Eclipse, med et Java Swing grensesnitt.
Selv om man ikke bruker Eclipse, så kan man likevel bruke JExercise til å teste egen kode fra kommando-linja. En bruker den samme jexercise-standalone.jar-fila som ellers, og må passe på at test-koden kompileres med denne i classpath'en.
Her en oppskrift og et eksempel på hvordan dette gjøres: