Emne - Bio-system teknologi - TKP4195
TKP4195 - Bio-system teknologi
Om emnet
Vurderingsordning
Vurderingsordning: Samlet karakter
Karakter: Bokstavkarakterer
| Vurdering | Vekting | Varighet | Delkarakter | Hjelpemidler |
|---|---|---|---|---|
| Labprosjekt | 30/100 | |||
| Skriftlig skoleeksamen | 70/100 | 4 timer | E |
Faglig innhold
Faget består av teori, oppgaver og datalaboratoriearbeid for å praktisere og simulere biosystemer og kunstig intelligens. Introduksjon til modellering og dynamiske systemer. Modellering av Michaelis-Menten og Monod-kinetikk, fosforyleringsprosesser, Hill-dynamikk, mikrobielle vekst og fermenteringsproesseser, genregulatoriske nettverk (GRN), masselov, kvasistasjonær tilstand, modellering av cellulær signaloverføring, dynamisk modellering av syntetisk biologi, genetiske kretser, motiver som vekslebrytere og oscillasjoner i bakterier, tilbakemelding og fremovermeldingsmotiver. Andre del av kurset: Modellering av dynamiske ligninger i sanntid, teori om parameterestimering og følsomhetsanalyse. Kunstig intelligens i praksis: Hybrid- og gråmodeller, integrering av nevrale nettverksmodeller (maskinlæring) for å tilpasse biomodellene til virkelige eksperimenter, datalæring. Vi vil også lære om biosystemer og dynamikk: Stabilitet, bi-stabilitet, grensesykluser og oscillasjoner i cellulær biologi.
Læringsutbytte
Ved slutten av faget vil studenten være i stand til å utvikle modeller av biosystemer, både på molekylært (genetisk) nivå og organismenivå. De vil kunne anvende maskinlæring og neural nettverksmodeller for å oppdatere dynamiske modeller i sanntid (læringsmodeller). Studentene vil forstå effekten av genetiske kretser og designe sine egne regulerende genkretser. De vil også forstå og kunne beskrive dynamiske egenskaper som genetiske brytere og oscillasjoner. De vil lære å bruke modeller for å utvikle og kontrollere cellulære og genetiske prosesser.
Læringsformer og aktiviteter
Forelesninger og øvinger. Øvingene vil være både teoretiske og tekniske. Emnet undervises i hovedsak på norsk, men kan undervises på engelsk dersom det er internasjonale studenter som ønsker å ta emnet. Faget består av mye data programmering, Matlab og Phython.
Mer om vurdering
Skriftlig eksamen teller 70% på total karakteren. Lab-oppgaven teller 30%.
Ved utsatt eksamen (kontinuasjonseksamen) kan skriftlig eksamen bli endret til muntlig eksamen.
Anbefalte forkunnskaper
Biologi/ biokjemi. Molekulær biologi er fordel, men ikke krav. Matematikk i første og andreårskurs anbefales (Matematikk 1, 2 og lineær algebra).
Forkunnskapskrav
Ingen.
Kursmateriell
Forelesningsnotater.
Versjon: 1
Studiepoeng:
7.5 SP
Studienivå: Høyere grads nivå
Termin nr.: 1
Undervises: VÅR 2025
Undervisningsspråk: Engelsk, Norsk
Sted: Trondheim
- Systembiologi
- Teknologiske fag
Eksamensinfo
Vurderingsordning: Samlet karakter
- Termin Statuskode Vurdering Vekting Hjelpemidler Dato Tid Eksamens- system Rom *
- Vår ORD Skriftlig skoleeksamen 70/100 E INSPERA
-
Rom Bygning Antall kandidater - Vår ORD Labprosjekt 30/100 INSPERA
-
Rom Bygning Antall kandidater - Sommer UTS Skriftlig skoleeksamen 70/100 E INSPERA
-
Rom Bygning Antall kandidater
- * Skriftlig eksamen plasseres på rom 3 dager før eksamensdato. Hvis mer enn ett rom er oppgitt, finner du ditt rom på Studentweb.
For mer info om oppmelding til og gjennomføring av eksamen, se "Innsida - Eksamen"